Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp49Q6P9L4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp49Q6P9L4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp49Q6P9L4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp49Q6P9L4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp49Q6P9L4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp49Q6P9L4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp49Q6P9L4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp49Q6P9L4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp49Q6P9L4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp49Q6P9L4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp49Q6P9L4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp49Q6P9L4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp49Q6P9L4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Usp49Q6P9L4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp49Q6P9L4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp49Q6P9L4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp49Q6P9L4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp49Q6P9L4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp49Q6P9L4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp49Q6P9L4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp49Q6P9L4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp49Q6P9L4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp49Q6P9L4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp49Q6P9L4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp49Q6P9L4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp49Q6P9L4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp49Q6P9L4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp49Q6P9L4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp49Q6P9L4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp49Q6P9L4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp49Q6P9L4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp49Q6P9L4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp49Q6P9L4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Usp49Q6P9L4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp49Q6P9L4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp49Q6P9L4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp49Q6P9L4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp49Q6P9L4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp49Q6P9L4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp49Q6P9L4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp49Q6P9L4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp49Q6P9L4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp49Q6P9L4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp49Q6P9L4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp49Q6P9L4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp49Q6P9L4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp49Q6P9L4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Usp49Q6P9L4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Usp49Q6P9L4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp49Q6P9L4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp49Q6P9L4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp49Q6P9L4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp49Q6P9L4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp49Q6P9L4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp49Q6P9L4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp49Q6P9L4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp49Q6P9L4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp49Q6P9L4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp49Q6P9L4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp49Q6P9L4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp49Q6P9L4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp49Q6P9L4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp49Q6P9L4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp49Q6P9L4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp49Q6P9L4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp49Q6P9L4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp49Q6P9L4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp49Q6P9L4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp49Q6P9L4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp49Q6P9L4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp49Q6P9L4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp49Q6P9L4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp49Q6P9L4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Usp49Q6P9L4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp49Q6P9L4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp49Q6P9L4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp49Q6P9L4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp49Q6P9L4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp49Q6P9L4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp49Q6P9L4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp49Q6P9L4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp49Q6P9L4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp49Q6P9L4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp49Q6P9L4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp49Q6P9L4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp49Q6P9L4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp49Q6P9L4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp49Q6P9L4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp49Q6P9L4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp49Q6P9L4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp49Q6P9L4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp49Q6P9L4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp49Q6P9L4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp49Q6P9L4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp49Q6P9L4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Usp49Q6P9L4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp49Q6P9L4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp49Q6P9L4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Usp49Q6P9L4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms