Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Alkbh2Q6P6J4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Alkbh2Q6P6J4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Alkbh2Q6P6J4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Alkbh2Q6P6J4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms