Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx19Q6P4T1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Snx19Q6P4T1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx19Q6P4T1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snx19Q6P4T1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snx19Q6P4T1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx19Q6P4T1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snx19Q6P4T1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx19Q6P4T1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snx19Q6P4T1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snx19Q6P4T1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx19Q6P4T1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx19Q6P4T1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx19Q6P4T1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snx19Q6P4T1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx19Q6P4T1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx19Q6P4T1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx19Q6P4T1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx19Q6P4T1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Snx19Q6P4T1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Snx19Q6P4T1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snx19Q6P4T1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snx19Q6P4T1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx19Q6P4T1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx19Q6P4T1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snx19Q6P4T1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx19Q6P4T1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx19Q6P4T1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snx19Q6P4T1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx19Q6P4T1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx19Q6P4T1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snx19Q6P4T1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx19Q6P4T1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snx19Q6P4T1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx19Q6P4T1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snx19Q6P4T1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snx19Q6P4T1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Snx19Q6P4T1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Snx19Q6P4T1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx19Q6P4T1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snx19Q6P4T1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx19Q6P4T1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx19Q6P4T1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx19Q6P4T1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Snx19Q6P4T1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx19Q6P4T1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx19Q6P4T1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Snx19Q6P4T1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx19Q6P4T1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx19Q6P4T1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx19Q6P4T1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snx19Q6P4T1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx19Q6P4T1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx19Q6P4T1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx19Q6P4T1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Snx19Q6P4T1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Snx19Q6P4T1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Snx19Q6P4T1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx19Q6P4T1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snx19Q6P4T1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx19Q6P4T1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx19Q6P4T1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snx19Q6P4T1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx19Q6P4T1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snx19Q6P4T1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx19Q6P4T1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx19Q6P4T1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx19Q6P4T1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snx19Q6P4T1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx19Q6P4T1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx19Q6P4T1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snx19Q6P4T1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx19Q6P4T1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx19Q6P4T1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx19Q6P4T1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx19Q6P4T1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx19Q6P4T1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snx19Q6P4T1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx19Q6P4T1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snx19Q6P4T1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snx19Q6P4T1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms