Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Podnl1Q6P3Y9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Podnl1Q6P3Y9 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Podnl1Q6P3Y9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Podnl1Q6P3Y9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Podnl1Q6P3Y9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Podnl1Q6P3Y9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Podnl1Q6P3Y9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Podnl1Q6P3Y9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Podnl1Q6P3Y9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Podnl1Q6P3Y9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Podnl1Q6P3Y9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Podnl1Q6P3Y9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Podnl1Q6P3Y9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Podnl1Q6P3Y9 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Podnl1Q6P3Y9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Podnl1Q6P3Y9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Podnl1Q6P3Y9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Podnl1Q6P3Y9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Podnl1Q6P3Y9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Podnl1Q6P3Y9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Podnl1Q6P3Y9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Podnl1Q6P3Y9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Podnl1Q6P3Y9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Podnl1Q6P3Y9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Podnl1Q6P3Y9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Podnl1Q6P3Y9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Podnl1Q6P3Y9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Podnl1Q6P3Y9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Podnl1Q6P3Y9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Podnl1Q6P3Y9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Podnl1Q6P3Y9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Podnl1Q6P3Y9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Podnl1Q6P3Y9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Podnl1Q6P3Y9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Podnl1Q6P3Y9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Podnl1Q6P3Y9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Podnl1Q6P3Y9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Podnl1Q6P3Y9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Podnl1Q6P3Y9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Podnl1Q6P3Y9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Podnl1Q6P3Y9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Podnl1Q6P3Y9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Podnl1Q6P3Y9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Podnl1Q6P3Y9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Podnl1Q6P3Y9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Podnl1Q6P3Y9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Podnl1Q6P3Y9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Podnl1Q6P3Y9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Podnl1Q6P3Y9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Podnl1Q6P3Y9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Podnl1Q6P3Y9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Podnl1Q6P3Y9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Podnl1Q6P3Y9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Podnl1Q6P3Y9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Podnl1Q6P3Y9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Podnl1Q6P3Y9 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Podnl1Q6P3Y9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Podnl1Q6P3Y9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Podnl1Q6P3Y9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Podnl1Q6P3Y9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Podnl1Q6P3Y9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Podnl1Q6P3Y9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Podnl1Q6P3Y9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Podnl1Q6P3Y9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Podnl1Q6P3Y9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Podnl1Q6P3Y9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Podnl1Q6P3Y9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Podnl1Q6P3Y9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Podnl1Q6P3Y9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Podnl1Q6P3Y9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Podnl1Q6P3Y9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Podnl1Q6P3Y9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Podnl1Q6P3Y9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Podnl1Q6P3Y9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Podnl1Q6P3Y9 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Podnl1Q6P3Y9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Podnl1Q6P3Y9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Podnl1Q6P3Y9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Podnl1Q6P3Y9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Podnl1Q6P3Y9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms