Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Casc4Q6P2L7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casc4Q6P2L7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casc4Q6P2L7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casc4Q6P2L7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Casc4Q6P2L7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Casc4Q6P2L7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casc4Q6P2L7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Casc4Q6P2L7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Casc4Q6P2L7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casc4Q6P2L7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casc4Q6P2L7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Casc4Q6P2L7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casc4Q6P2L7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Casc4Q6P2L7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casc4Q6P2L7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casc4Q6P2L7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casc4Q6P2L7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casc4Q6P2L7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Casc4Q6P2L7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casc4Q6P2L7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casc4Q6P2L7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Casc4Q6P2L7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Casc4Q6P2L7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Casc4Q6P2L7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casc4Q6P2L7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casc4Q6P2L7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Casc4Q6P2L7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casc4Q6P2L7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casc4Q6P2L7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Casc4Q6P2L7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casc4Q6P2L7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Casc4Q6P2L7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casc4Q6P2L7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Casc4Q6P2L7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Casc4Q6P2L7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Casc4Q6P2L7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casc4Q6P2L7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casc4Q6P2L7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casc4Q6P2L7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casc4Q6P2L7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Casc4Q6P2L7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Casc4Q6P2L7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Casc4Q6P2L7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casc4Q6P2L7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Casc4Q6P2L7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casc4Q6P2L7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Casc4Q6P2L7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casc4Q6P2L7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casc4Q6P2L7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casc4Q6P2L7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Casc4Q6P2L7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Casc4Q6P2L7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Casc4Q6P2L7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms