Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVG7

Colgalt2, Procollagen galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colgalt2Q6NVG7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Colgalt2Q6NVG7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Colgalt2Q6NVG7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Colgalt2Q6NVG7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Colgalt2Q6NVG7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Colgalt2Q6NVG7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Colgalt2Q6NVG7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Colgalt2Q6NVG7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Colgalt2Q6NVG7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Colgalt2Q6NVG7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Colgalt2Q6NVG7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Colgalt2Q6NVG7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Colgalt2Q6NVG7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Colgalt2Q6NVG7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Colgalt2Q6NVG7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Colgalt2Q6NVG7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Colgalt2Q6NVG7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Colgalt2Q6NVG7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Colgalt2Q6NVG7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Colgalt2Q6NVG7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Colgalt2Q6NVG7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Colgalt2Q6NVG7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Colgalt2Q6NVG7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Colgalt2Q6NVG7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Colgalt2Q6NVG7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Colgalt2Q6NVG7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Colgalt2Q6NVG7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Colgalt2Q6NVG7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Colgalt2Q6NVG7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Colgalt2Q6NVG7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Colgalt2Q6NVG7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Colgalt2Q6NVG7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Colgalt2Q6NVG7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Colgalt2Q6NVG7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Colgalt2Q6NVG7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Colgalt2Q6NVG7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Colgalt2Q6NVG7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Colgalt2Q6NVG7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Colgalt2Q6NVG7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Colgalt2Q6NVG7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Colgalt2Q6NVG7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Colgalt2Q6NVG7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Colgalt2Q6NVG7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Colgalt2Q6NVG7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Colgalt2Q6NVG7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Colgalt2Q6NVG7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Colgalt2Q6NVG7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Colgalt2Q6NVG7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Colgalt2Q6NVG7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Colgalt2Q6NVG7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Colgalt2Q6NVG7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Colgalt2Q6NVG7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Colgalt2Q6NVG7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Colgalt2Q6NVG7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Colgalt2Q6NVG7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Colgalt2Q6NVG7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Colgalt2Q6NVG7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Colgalt2Q6NVG7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Colgalt2Q6NVG7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Colgalt2Q6NVG7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms