Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS60

Fbxo41, F-box only protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo41Q6NS60 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Fbxo41Q6NS60 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fbxo41Q6NS60 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fbxo41Q6NS60 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Fbxo41Q6NS60 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Fbxo41Q6NS60 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Fbxo41Q6NS60 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Fbxo41Q6NS60 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Fbxo41Q6NS60 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Fbxo41Q6NS60 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Fbxo41Q6NS60 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Fbxo41Q6NS60 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Fbxo41Q6NS60 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Fbxo41Q6NS60 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Fbxo41Q6NS60 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fbxo41Q6NS60 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fbxo41Q6NS60 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Fbxo41Q6NS60 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Fbxo41Q6NS60 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fbxo41Q6NS60 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fbxo41Q6NS60 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Fbxo41Q6NS60 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fbxo41Q6NS60 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fbxo41Q6NS60 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fbxo41Q6NS60 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Fbxo41Q6NS60 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Fbxo41Q6NS60 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Fbxo41Q6NS60 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fbxo41Q6NS60 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Fbxo41Q6NS60 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fbxo41Q6NS60 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fbxo41Q6NS60 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Fbxo41Q6NS60 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Fbxo41Q6NS60 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Fbxo41Q6NS60 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Fbxo41Q6NS60 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fbxo41Q6NS60 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Fbxo41Q6NS60 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Fbxo41Q6NS60 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Fbxo41Q6NS60 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Fbxo41Q6NS60 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Fbxo41Q6NS60 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Fbxo41Q6NS60 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Fbxo41Q6NS60 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Fbxo41Q6NS60 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
Fbxo41Q6NS60 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Fbxo41Q6NS60 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Fbxo41Q6NS60 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
Fbxo41Q6NS60 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Fbxo41Q6NS60 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Fbxo41Q6NS60 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Fbxo41Q6NS60 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Fbxo41Q6NS60 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fbxo41Q6NS60 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fbxo41Q6NS60 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fbxo41Q6NS60 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Fbxo41Q6NS60 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Fbxo41Q6NS60 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Fbxo41Q6NS60 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Fbxo41Q6NS60 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Fbxo41Q6NS60 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Fbxo41Q6NS60 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Fbxo41Q6NS60 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Fbxo41Q6NS60 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Fbxo41Q6NS60 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Fbxo41Q6NS60 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fbxo41Q6NS60 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Fbxo41Q6NS60 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Fbxo41Q6NS60 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Fbxo41Q6NS60 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fbxo41Q6NS60 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Fbxo41Q6NS60 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Fbxo41Q6NS60 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Fbxo41Q6NS60 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Fbxo41Q6NS60 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Fbxo41Q6NS60 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Fbxo41Q6NS60 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Fbxo41Q6NS60 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Fbxo41Q6NS60 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Fbxo41Q6NS60 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Fbxo41Q6NS60 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
Fbxo41Q6NS60 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fbxo41Q6NS60 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fbxo41Q6NS60 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fbxo41Q6NS60 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Fbxo41Q6NS60 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Fbxo41Q6NS60 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Fbxo41Q6NS60 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Fbxo41Q6NS60 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Fbxo41Q6NS60 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Fbxo41Q6NS60 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
Fbxo41Q6NS60 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Fbxo41Q6NS60 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Fbxo41Q6NS60 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Fbxo41Q6NS60 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Fbxo41Q6NS60 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Fbxo41Q6NS60 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Fbxo41Q6NS60 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Fbxo41Q6NS60 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Fbxo41Q6NS60 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms