Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cep78Q6IRU7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep78Q6IRU7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cep78Q6IRU7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep78Q6IRU7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cep78Q6IRU7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep78Q6IRU7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep78Q6IRU7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep78Q6IRU7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep78Q6IRU7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep78Q6IRU7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep78Q6IRU7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep78Q6IRU7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep78Q6IRU7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep78Q6IRU7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cep78Q6IRU7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cep78Q6IRU7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cep78Q6IRU7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cep78Q6IRU7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep78Q6IRU7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cep78Q6IRU7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep78Q6IRU7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep78Q6IRU7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep78Q6IRU7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep78Q6IRU7 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep78Q6IRU7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep78Q6IRU7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep78Q6IRU7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep78Q6IRU7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep78Q6IRU7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep78Q6IRU7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep78Q6IRU7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep78Q6IRU7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep78Q6IRU7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep78Q6IRU7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep78Q6IRU7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cep78Q6IRU7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep78Q6IRU7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep78Q6IRU7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep78Q6IRU7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep78Q6IRU7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep78Q6IRU7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep78Q6IRU7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cep78Q6IRU7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep78Q6IRU7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep78Q6IRU7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep78Q6IRU7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep78Q6IRU7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cep78Q6IRU7 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep78Q6IRU7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep78Q6IRU7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep78Q6IRU7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep78Q6IRU7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep78Q6IRU7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep78Q6IRU7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cep78Q6IRU7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep78Q6IRU7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep78Q6IRU7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep78Q6IRU7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep78Q6IRU7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep78Q6IRU7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep78Q6IRU7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep78Q6IRU7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep78Q6IRU7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep78Q6IRU7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep78Q6IRU7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep78Q6IRU7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep78Q6IRU7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep78Q6IRU7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cep78Q6IRU7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cep78Q6IRU7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms