Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp11bQ6DFW5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp11bQ6DFW5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp11bQ6DFW5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp11bQ6DFW5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp11bQ6DFW5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp11bQ6DFW5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp11bQ6DFW5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp11bQ6DFW5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp11bQ6DFW5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp11bQ6DFW5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp11bQ6DFW5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp11bQ6DFW5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp11bQ6DFW5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp11bQ6DFW5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp11bQ6DFW5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp11bQ6DFW5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp11bQ6DFW5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp11bQ6DFW5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp11bQ6DFW5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp11bQ6DFW5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atp11bQ6DFW5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp11bQ6DFW5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp11bQ6DFW5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp11bQ6DFW5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp11bQ6DFW5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp11bQ6DFW5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp11bQ6DFW5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp11bQ6DFW5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp11bQ6DFW5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp11bQ6DFW5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp11bQ6DFW5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp11bQ6DFW5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp11bQ6DFW5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp11bQ6DFW5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp11bQ6DFW5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp11bQ6DFW5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp11bQ6DFW5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp11bQ6DFW5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp11bQ6DFW5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp11bQ6DFW5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp11bQ6DFW5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp11bQ6DFW5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp11bQ6DFW5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp11bQ6DFW5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp11bQ6DFW5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp11bQ6DFW5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp11bQ6DFW5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp11bQ6DFW5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp11bQ6DFW5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp11bQ6DFW5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp11bQ6DFW5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp11bQ6DFW5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp11bQ6DFW5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp11bQ6DFW5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp11bQ6DFW5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp11bQ6DFW5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp11bQ6DFW5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp11bQ6DFW5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp11bQ6DFW5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp11bQ6DFW5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp11bQ6DFW5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp11bQ6DFW5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp11bQ6DFW5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp11bQ6DFW5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp11bQ6DFW5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp11bQ6DFW5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp11bQ6DFW5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp11bQ6DFW5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp11bQ6DFW5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp11bQ6DFW5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp11bQ6DFW5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp11bQ6DFW5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp11bQ6DFW5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp11bQ6DFW5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp11bQ6DFW5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp11bQ6DFW5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp11bQ6DFW5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp11bQ6DFW5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp11bQ6DFW5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Atp11bQ6DFW5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms