Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fndc3c1Q6DFV6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Fndc3c1Q6DFV6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Fndc3c1Q6DFV6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Fndc3c1Q6DFV6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fndc3c1Q6DFV6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Fndc3c1Q6DFV6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Fndc3c1Q6DFV6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Fndc3c1Q6DFV6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fndc3c1Q6DFV6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fndc3c1Q6DFV6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fndc3c1Q6DFV6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Fndc3c1Q6DFV6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Fndc3c1Q6DFV6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Fndc3c1Q6DFV6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fndc3c1Q6DFV6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Fndc3c1Q6DFV6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Fndc3c1Q6DFV6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fndc3c1Q6DFV6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Fndc3c1Q6DFV6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Fndc3c1Q6DFV6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fndc3c1Q6DFV6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Fndc3c1Q6DFV6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fndc3c1Q6DFV6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fndc3c1Q6DFV6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Fndc3c1Q6DFV6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Fndc3c1Q6DFV6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fndc3c1Q6DFV6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fndc3c1Q6DFV6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fndc3c1Q6DFV6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fndc3c1Q6DFV6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fndc3c1Q6DFV6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fndc3c1Q6DFV6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fndc3c1Q6DFV6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Fndc3c1Q6DFV6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fndc3c1Q6DFV6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Fndc3c1Q6DFV6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fndc3c1Q6DFV6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fndc3c1Q6DFV6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fndc3c1Q6DFV6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fndc3c1Q6DFV6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fndc3c1Q6DFV6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fndc3c1Q6DFV6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fndc3c1Q6DFV6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Fndc3c1Q6DFV6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fndc3c1Q6DFV6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fndc3c1Q6DFV6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fndc3c1Q6DFV6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Fndc3c1Q6DFV6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Fndc3c1Q6DFV6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fndc3c1Q6DFV6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fndc3c1Q6DFV6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fndc3c1Q6DFV6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fndc3c1Q6DFV6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fndc3c1Q6DFV6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Fndc3c1Q6DFV6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fndc3c1Q6DFV6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fndc3c1Q6DFV6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fndc3c1Q6DFV6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fndc3c1Q6DFV6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Fndc3c1Q6DFV6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fndc3c1Q6DFV6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fndc3c1Q6DFV6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fndc3c1Q6DFV6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fndc3c1Q6DFV6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc3c1Q6DFV6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc3c1Q6DFV6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc3c1Q6DFV6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc3c1Q6DFV6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc3c1Q6DFV6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Fndc3c1Q6DFV6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Fndc3c1Q6DFV6 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms