Protein–RNA interactions for Protein: Q64322

Npdc1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npdc1Q64322 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npdc1Q64322 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npdc1Q64322 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Npdc1Q64322 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Npdc1Q64322 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Npdc1Q64322 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npdc1Q64322 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Npdc1Q64322 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npdc1Q64322 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npdc1Q64322 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npdc1Q64322 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npdc1Q64322 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Npdc1Q64322 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Npdc1Q64322 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Npdc1Q64322 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Npdc1Q64322 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Npdc1Q64322 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms