Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CcncQ62447 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CcncQ62447 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CcncQ62447 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CcncQ62447 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CcncQ62447 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CcncQ62447 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CcncQ62447 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CcncQ62447 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CcncQ62447 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CcncQ62447 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CcncQ62447 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CcncQ62447 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CcncQ62447 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CcncQ62447 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CcncQ62447 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CcncQ62447 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CcncQ62447 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CcncQ62447 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CcncQ62447 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CcncQ62447 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CcncQ62447 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CcncQ62447 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CcncQ62447 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CcncQ62447 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CcncQ62447 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CcncQ62447 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CcncQ62447 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CcncQ62447 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CcncQ62447 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CcncQ62447 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CcncQ62447 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CcncQ62447 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CcncQ62447 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CcncQ62447 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CcncQ62447 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CcncQ62447 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CcncQ62447 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CcncQ62447 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CcncQ62447 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CcncQ62447 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CcncQ62447 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CcncQ62447 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CcncQ62447 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CcncQ62447 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CcncQ62447 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CcncQ62447 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CcncQ62447 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CcncQ62447 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CcncQ62447 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CcncQ62447 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CcncQ62447 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CcncQ62447 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CcncQ62447 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CcncQ62447 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CcncQ62447 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CcncQ62447 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CcncQ62447 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CcncQ62447 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CcncQ62447 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CcncQ62447 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CcncQ62447 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CcncQ62447 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CcncQ62447 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcncQ62447 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcncQ62447 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcncQ62447 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CcncQ62447 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CcncQ62447 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CcncQ62447 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CcncQ62447 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CcncQ62447 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CcncQ62447 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CcncQ62447 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CcncQ62447 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CcncQ62447 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CcncQ62447 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcncQ62447 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcncQ62447 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CcncQ62447 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CcncQ62447 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CcncQ62447 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CcncQ62447 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CcncQ62447 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcncQ62447 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcncQ62447 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcncQ62447 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CcncQ62447 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CcncQ62447 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CcncQ62447 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CcncQ62447 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CcncQ62447 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcncQ62447 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcncQ62447 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CcncQ62447 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcncQ62447 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcncQ62447 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CcncQ62447 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CcncQ62447 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CcncQ62447 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms