Protein–RNA interactions for Protein: Q62407

Speg, Striated muscle-specific serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 3,262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpegQ62407 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SpegQ62407 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SpegQ62407 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpegQ62407 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpegQ62407 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpegQ62407 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpegQ62407 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SpegQ62407 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SpegQ62407 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SpegQ62407 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SpegQ62407 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SpegQ62407 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SpegQ62407 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SpegQ62407 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SpegQ62407 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SpegQ62407 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SpegQ62407 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SpegQ62407 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SpegQ62407 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SpegQ62407 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SpegQ62407 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SpegQ62407 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SpegQ62407 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SpegQ62407 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SpegQ62407 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpegQ62407 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpegQ62407 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpegQ62407 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SpegQ62407 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SpegQ62407 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SpegQ62407 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SpegQ62407 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpegQ62407 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SpegQ62407 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SpegQ62407 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SpegQ62407 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SpegQ62407 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SpegQ62407 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SpegQ62407 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SpegQ62407 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SpegQ62407 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SpegQ62407 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpegQ62407 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpegQ62407 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpegQ62407 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpegQ62407 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SpegQ62407 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpegQ62407 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SpegQ62407 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpegQ62407 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpegQ62407 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SpegQ62407 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SpegQ62407 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SpegQ62407 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SpegQ62407 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SpegQ62407 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SpegQ62407 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SpegQ62407 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpegQ62407 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpegQ62407 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpegQ62407 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SpegQ62407 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SpegQ62407 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SpegQ62407 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SpegQ62407 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SpegQ62407 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SpegQ62407 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SpegQ62407 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SpegQ62407 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms