Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Sall3Q62255 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Sall3Q62255 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Sall3Q62255 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Sall3Q62255 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Sall3Q62255 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sall3Q62255 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Sall3Q62255 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Sall3Q62255 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Sall3Q62255 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Sall3Q62255 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Sall3Q62255 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Sall3Q62255 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Sall3Q62255 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Sall3Q62255 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Sall3Q62255 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Sall3Q62255 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Sall3Q62255 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Sall3Q62255 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Sall3Q62255 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
Sall3Q62255 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Sall3Q62255 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Sall3Q62255 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Sall3Q62255 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Sall3Q62255 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Sall3Q62255 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Sall3Q62255 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Sall3Q62255 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Sall3Q62255 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
Sall3Q62255 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Sall3Q62255 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Sall3Q62255 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Sall3Q62255 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Sall3Q62255 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Sall3Q62255 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Sall3Q62255 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.78■■■■□ 3
Sall3Q62255 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Sall3Q62255 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Sall3Q62255 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Sall3Q62255 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Sall3Q62255 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Sall3Q62255 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Sall3Q62255 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Sall3Q62255 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Sall3Q62255 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Sall3Q62255 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Sall3Q62255 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
Sall3Q62255 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Sall3Q62255 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Sall3Q62255 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Sall3Q62255 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Sall3Q62255 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sall3Q62255 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Sall3Q62255 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Sall3Q62255 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Sall3Q62255 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
Sall3Q62255 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Sall3Q62255 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Sall3Q62255 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Sall3Q62255 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Sall3Q62255 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Sall3Q62255 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Sall3Q62255 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Sall3Q62255 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Sall3Q62255 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Sall3Q62255 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Sall3Q62255 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Sall3Q62255 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Sall3Q62255 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Sall3Q62255 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Sall3Q62255 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Sall3Q62255 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Sall3Q62255 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
Sall3Q62255 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Sall3Q62255 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Sall3Q62255 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Sall3Q62255 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Sall3Q62255 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sall3Q62255 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sall3Q62255 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Sall3Q62255 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms