Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttf1Q62187 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ttf1Q62187 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttf1Q62187 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ttf1Q62187 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttf1Q62187 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttf1Q62187 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttf1Q62187 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ttf1Q62187 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttf1Q62187 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttf1Q62187 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttf1Q62187 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ttf1Q62187 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttf1Q62187 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttf1Q62187 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttf1Q62187 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ttf1Q62187 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ttf1Q62187 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttf1Q62187 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttf1Q62187 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ttf1Q62187 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttf1Q62187 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttf1Q62187 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttf1Q62187 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ttf1Q62187 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttf1Q62187 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ttf1Q62187 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttf1Q62187 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttf1Q62187 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ttf1Q62187 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ttf1Q62187 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
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