Protein–RNA interactions for Protein: Q60738

Slc30a1, Zinc transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc30a1Q60738 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc30a1Q60738 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc30a1Q60738 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc30a1Q60738 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc30a1Q60738 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc30a1Q60738 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc30a1Q60738 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc30a1Q60738 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc30a1Q60738 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc30a1Q60738 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc30a1Q60738 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc30a1Q60738 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc30a1Q60738 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc30a1Q60738 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc30a1Q60738 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc30a1Q60738 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc30a1Q60738 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms