Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc5a6Q5U4D8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc5a6Q5U4D8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc5a6Q5U4D8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc5a6Q5U4D8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc5a6Q5U4D8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc5a6Q5U4D8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc5a6Q5U4D8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc5a6Q5U4D8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc5a6Q5U4D8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc5a6Q5U4D8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc5a6Q5U4D8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc5a6Q5U4D8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc5a6Q5U4D8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc5a6Q5U4D8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc5a6Q5U4D8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Slc5a6Q5U4D8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc5a6Q5U4D8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc5a6Q5U4D8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a6Q5U4D8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a6Q5U4D8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a6Q5U4D8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a6Q5U4D8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a6Q5U4D8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc5a6Q5U4D8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc5a6Q5U4D8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a6Q5U4D8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a6Q5U4D8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a6Q5U4D8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc5a6Q5U4D8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a6Q5U4D8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc5a6Q5U4D8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc5a6Q5U4D8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a6Q5U4D8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a6Q5U4D8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc5a6Q5U4D8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc5a6Q5U4D8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc5a6Q5U4D8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms