Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc125Q5U465 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc125Q5U465 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc125Q5U465 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc125Q5U465 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc125Q5U465 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc125Q5U465 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc125Q5U465 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc125Q5U465 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc125Q5U465 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc125Q5U465 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc125Q5U465 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ccdc125Q5U465 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc125Q5U465 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc125Q5U465 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ccdc125Q5U465 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ccdc125Q5U465 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc125Q5U465 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc125Q5U465 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ccdc125Q5U465 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ccdc125Q5U465 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccdc125Q5U465 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc125Q5U465 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ccdc125Q5U465 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc125Q5U465 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc125Q5U465 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc125Q5U465 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ccdc125Q5U465 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc125Q5U465 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ccdc125Q5U465 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc125Q5U465 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc125Q5U465 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc125Q5U465 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc125Q5U465 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccdc125Q5U465 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccdc125Q5U465 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc125Q5U465 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ccdc125Q5U465 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc125Q5U465 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc125Q5U465 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ccdc125Q5U465 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc125Q5U465 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc125Q5U465 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ccdc125Q5U465 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc125Q5U465 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc125Q5U465 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ccdc125Q5U465 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc125Q5U465 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc125Q5U465 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccdc125Q5U465 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc125Q5U465 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc125Q5U465 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc125Q5U465 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ccdc125Q5U465 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc125Q5U465 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc125Q5U465 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc125Q5U465 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc125Q5U465 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ccdc125Q5U465 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc125Q5U465 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccdc125Q5U465 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ccdc125Q5U465 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc125Q5U465 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc125Q5U465 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc125Q5U465 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccdc125Q5U465 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ccdc125Q5U465 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ccdc125Q5U465 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc125Q5U465 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc125Q5U465 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ccdc125Q5U465 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc125Q5U465 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ccdc125Q5U465 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc125Q5U465 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ccdc125Q5U465 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ccdc125Q5U465 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc125Q5U465 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ccdc125Q5U465 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ccdc125Q5U465 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms