Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD0

Rflnb, Refilin-B, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RflnbQ5SVD0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RflnbQ5SVD0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RflnbQ5SVD0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RflnbQ5SVD0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RflnbQ5SVD0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RflnbQ5SVD0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RflnbQ5SVD0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RflnbQ5SVD0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RflnbQ5SVD0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RflnbQ5SVD0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RflnbQ5SVD0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RflnbQ5SVD0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RflnbQ5SVD0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RflnbQ5SVD0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RflnbQ5SVD0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RflnbQ5SVD0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RflnbQ5SVD0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RflnbQ5SVD0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RflnbQ5SVD0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RflnbQ5SVD0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RflnbQ5SVD0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RflnbQ5SVD0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RflnbQ5SVD0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RflnbQ5SVD0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RflnbQ5SVD0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RflnbQ5SVD0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RflnbQ5SVD0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RflnbQ5SVD0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RflnbQ5SVD0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RflnbQ5SVD0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RflnbQ5SVD0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RflnbQ5SVD0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RflnbQ5SVD0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RflnbQ5SVD0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RflnbQ5SVD0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RflnbQ5SVD0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RflnbQ5SVD0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RflnbQ5SVD0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RflnbQ5SVD0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RflnbQ5SVD0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RflnbQ5SVD0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RflnbQ5SVD0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RflnbQ5SVD0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RflnbQ5SVD0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RflnbQ5SVD0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RflnbQ5SVD0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RflnbQ5SVD0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RflnbQ5SVD0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RflnbQ5SVD0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RflnbQ5SVD0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RflnbQ5SVD0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RflnbQ5SVD0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RflnbQ5SVD0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RflnbQ5SVD0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RflnbQ5SVD0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RflnbQ5SVD0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RflnbQ5SVD0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RflnbQ5SVD0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RflnbQ5SVD0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RflnbQ5SVD0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RflnbQ5SVD0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms