Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AbrQ5SSL4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AbrQ5SSL4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AbrQ5SSL4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AbrQ5SSL4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AbrQ5SSL4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AbrQ5SSL4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AbrQ5SSL4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AbrQ5SSL4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AbrQ5SSL4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AbrQ5SSL4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AbrQ5SSL4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AbrQ5SSL4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AbrQ5SSL4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AbrQ5SSL4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AbrQ5SSL4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AbrQ5SSL4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AbrQ5SSL4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AbrQ5SSL4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AbrQ5SSL4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AbrQ5SSL4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AbrQ5SSL4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AbrQ5SSL4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AbrQ5SSL4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AbrQ5SSL4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AbrQ5SSL4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AbrQ5SSL4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AbrQ5SSL4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AbrQ5SSL4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AbrQ5SSL4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AbrQ5SSL4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AbrQ5SSL4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AbrQ5SSL4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AbrQ5SSL4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AbrQ5SSL4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AbrQ5SSL4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AbrQ5SSL4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AbrQ5SSL4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AbrQ5SSL4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AbrQ5SSL4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AbrQ5SSL4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AbrQ5SSL4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AbrQ5SSL4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AbrQ5SSL4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
AbrQ5SSL4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AbrQ5SSL4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AbrQ5SSL4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AbrQ5SSL4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AbrQ5SSL4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AbrQ5SSL4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AbrQ5SSL4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AbrQ5SSL4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AbrQ5SSL4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AbrQ5SSL4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AbrQ5SSL4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AbrQ5SSL4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AbrQ5SSL4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AbrQ5SSL4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AbrQ5SSL4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AbrQ5SSL4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AbrQ5SSL4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AbrQ5SSL4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AbrQ5SSL4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms