Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Fbxo39Q5NBU5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Fbxo39Q5NBU5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Fbxo39Q5NBU5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo39Q5NBU5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo39Q5NBU5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Fbxo39Q5NBU5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo39Q5NBU5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo39Q5NBU5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Fbxo39Q5NBU5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo39Q5NBU5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo39Q5NBU5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo39Q5NBU5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Fbxo39Q5NBU5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo39Q5NBU5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo39Q5NBU5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Fbxo39Q5NBU5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fbxo39Q5NBU5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo39Q5NBU5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo39Q5NBU5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fbxo39Q5NBU5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo39Q5NBU5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Fbxo39Q5NBU5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo39Q5NBU5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo39Q5NBU5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo39Q5NBU5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo39Q5NBU5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fbxo39Q5NBU5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo39Q5NBU5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fbxo39Q5NBU5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fbxo39Q5NBU5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fbxo39Q5NBU5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fbxo39Q5NBU5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fbxo39Q5NBU5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fbxo39Q5NBU5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fbxo39Q5NBU5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fbxo39Q5NBU5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fbxo39Q5NBU5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Fbxo39Q5NBU5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fbxo39Q5NBU5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fbxo39Q5NBU5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fbxo39Q5NBU5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo39Q5NBU5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo39Q5NBU5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo39Q5NBU5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo39Q5NBU5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fbxo39Q5NBU5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fbxo39Q5NBU5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo39Q5NBU5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo39Q5NBU5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo39Q5NBU5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fbxo39Q5NBU5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Fbxo39Q5NBU5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxo39Q5NBU5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxo39Q5NBU5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxo39Q5NBU5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fbxo39Q5NBU5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbxo39Q5NBU5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbxo39Q5NBU5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fbxo39Q5NBU5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fbxo39Q5NBU5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fbxo39Q5NBU5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Fbxo39Q5NBU5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fbxo39Q5NBU5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms