Protein–RNA interactions for Protein: Q5D1E7

Zc3h12a, Endoribonuclease ZC3H12A, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h12aQ5D1E7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zc3h12aQ5D1E7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Zc3h12aQ5D1E7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zc3h12aQ5D1E7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zc3h12aQ5D1E7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zc3h12aQ5D1E7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zc3h12aQ5D1E7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zc3h12aQ5D1E7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zc3h12aQ5D1E7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zc3h12aQ5D1E7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h12aQ5D1E7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h12aQ5D1E7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h12aQ5D1E7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zc3h12aQ5D1E7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h12aQ5D1E7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h12aQ5D1E7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h12aQ5D1E7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zc3h12aQ5D1E7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zc3h12aQ5D1E7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zc3h12aQ5D1E7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h12aQ5D1E7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h12aQ5D1E7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h12aQ5D1E7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h12aQ5D1E7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h12aQ5D1E7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zc3h12aQ5D1E7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h12aQ5D1E7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h12aQ5D1E7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zc3h12aQ5D1E7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zc3h12aQ5D1E7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zc3h12aQ5D1E7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h12aQ5D1E7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zc3h12aQ5D1E7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h12aQ5D1E7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zc3h12aQ5D1E7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zc3h12aQ5D1E7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zc3h12aQ5D1E7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zc3h12aQ5D1E7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h12aQ5D1E7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h12aQ5D1E7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zc3h12aQ5D1E7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h12aQ5D1E7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h12aQ5D1E7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h12aQ5D1E7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h12aQ5D1E7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h12aQ5D1E7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zc3h12aQ5D1E7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h12aQ5D1E7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h12aQ5D1E7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zc3h12aQ5D1E7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h12aQ5D1E7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h12aQ5D1E7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zc3h12aQ5D1E7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h12aQ5D1E7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zc3h12aQ5D1E7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h12aQ5D1E7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zc3h12aQ5D1E7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Zc3h12aQ5D1E7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms