Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ndufaf2Q59J78 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ndufaf2Q59J78 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Ndufaf2Q59J78 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ndufaf2Q59J78 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndufaf2Q59J78 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndufaf2Q59J78 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndufaf2Q59J78 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ndufaf2Q59J78 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufaf2Q59J78 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufaf2Q59J78 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ndufaf2Q59J78 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndufaf2Q59J78 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndufaf2Q59J78 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ndufaf2Q59J78 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufaf2Q59J78 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufaf2Q59J78 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ndufaf2Q59J78 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufaf2Q59J78 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufaf2Q59J78 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ndufaf2Q59J78 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufaf2Q59J78 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufaf2Q59J78 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufaf2Q59J78 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufaf2Q59J78 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ndufaf2Q59J78 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufaf2Q59J78 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufaf2Q59J78 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufaf2Q59J78 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ndufaf2Q59J78 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufaf2Q59J78 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ndufaf2Q59J78 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ndufaf2Q59J78 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufaf2Q59J78 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ndufaf2Q59J78 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ndufaf2Q59J78 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms