Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2al1nQ497L1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2al1nQ497L1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2al1nQ497L1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2al1nQ497L1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al1nQ497L1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1nQ497L1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al1nQ497L1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al1nQ497L1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al1nQ497L1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al1nQ497L1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al1nQ497L1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al1nQ497L1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al1nQ497L1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1nQ497L1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1nQ497L1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1nQ497L1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1nQ497L1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1nQ497L1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms