Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1D5

Pnpla1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla1Q3V1D5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnpla1Q3V1D5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnpla1Q3V1D5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pnpla1Q3V1D5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnpla1Q3V1D5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnpla1Q3V1D5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pnpla1Q3V1D5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pnpla1Q3V1D5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pnpla1Q3V1D5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pnpla1Q3V1D5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pnpla1Q3V1D5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pnpla1Q3V1D5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pnpla1Q3V1D5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pnpla1Q3V1D5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pnpla1Q3V1D5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pnpla1Q3V1D5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pnpla1Q3V1D5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pnpla1Q3V1D5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pnpla1Q3V1D5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pnpla1Q3V1D5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnpla1Q3V1D5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnpla1Q3V1D5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pnpla1Q3V1D5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pnpla1Q3V1D5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pnpla1Q3V1D5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnpla1Q3V1D5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnpla1Q3V1D5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pnpla1Q3V1D5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pnpla1Q3V1D5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pnpla1Q3V1D5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pnpla1Q3V1D5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pnpla1Q3V1D5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pnpla1Q3V1D5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla1Q3V1D5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla1Q3V1D5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla1Q3V1D5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla1Q3V1D5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla1Q3V1D5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pnpla1Q3V1D5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnpla1Q3V1D5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnpla1Q3V1D5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pnpla1Q3V1D5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pnpla1Q3V1D5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnpla1Q3V1D5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pnpla1Q3V1D5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnpla1Q3V1D5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnpla1Q3V1D5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pnpla1Q3V1D5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnpla1Q3V1D5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnpla1Q3V1D5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pnpla1Q3V1D5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pnpla1Q3V1D5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms