Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Y1

Ppp4r3c, Protein PPP4R3C, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3cQ3V0Y1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp4r3cQ3V0Y1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp4r3cQ3V0Y1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp4r3cQ3V0Y1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ppp4r3cQ3V0Y1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ppp4r3cQ3V0Y1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp4r3cQ3V0Y1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp4r3cQ3V0Y1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ppp4r3cQ3V0Y1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ppp4r3cQ3V0Y1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp4r3cQ3V0Y1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp4r3cQ3V0Y1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp4r3cQ3V0Y1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ppp4r3cQ3V0Y1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ppp4r3cQ3V0Y1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r3cQ3V0Y1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ppp4r3cQ3V0Y1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ppp4r3cQ3V0Y1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ppp4r3cQ3V0Y1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppp4r3cQ3V0Y1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms