Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M8

BC051142, Testis specific basic protein, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051142Q3V0M8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BC051142Q3V0M8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BC051142Q3V0M8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BC051142Q3V0M8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BC051142Q3V0M8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BC051142Q3V0M8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BC051142Q3V0M8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC051142Q3V0M8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC051142Q3V0M8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BC051142Q3V0M8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BC051142Q3V0M8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BC051142Q3V0M8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BC051142Q3V0M8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BC051142Q3V0M8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BC051142Q3V0M8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BC051142Q3V0M8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BC051142Q3V0M8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BC051142Q3V0M8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BC051142Q3V0M8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BC051142Q3V0M8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BC051142Q3V0M8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BC051142Q3V0M8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BC051142Q3V0M8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BC051142Q3V0M8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BC051142Q3V0M8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BC051142Q3V0M8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC051142Q3V0M8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC051142Q3V0M8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC051142Q3V0M8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BC051142Q3V0M8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BC051142Q3V0M8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BC051142Q3V0M8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC051142Q3V0M8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC051142Q3V0M8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC051142Q3V0M8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BC051142Q3V0M8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BC051142Q3V0M8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BC051142Q3V0M8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BC051142Q3V0M8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BC051142Q3V0M8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BC051142Q3V0M8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BC051142Q3V0M8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC051142Q3V0M8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BC051142Q3V0M8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC051142Q3V0M8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BC051142Q3V0M8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BC051142Q3V0M8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BC051142Q3V0M8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BC051142Q3V0M8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BC051142Q3V0M8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BC051142Q3V0M8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BC051142Q3V0M8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms