Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lrrc43Q3V0L5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Lrrc43Q3V0L5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Lrrc43Q3V0L5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lrrc43Q3V0L5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lrrc43Q3V0L5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lrrc43Q3V0L5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lrrc43Q3V0L5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lrrc43Q3V0L5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lrrc43Q3V0L5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lrrc43Q3V0L5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lrrc43Q3V0L5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lrrc43Q3V0L5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Lrrc43Q3V0L5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lrrc43Q3V0L5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lrrc43Q3V0L5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lrrc43Q3V0L5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lrrc43Q3V0L5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lrrc43Q3V0L5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lrrc43Q3V0L5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Lrrc43Q3V0L5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Lrrc43Q3V0L5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lrrc43Q3V0L5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lrrc43Q3V0L5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lrrc43Q3V0L5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lrrc43Q3V0L5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lrrc43Q3V0L5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lrrc43Q3V0L5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lrrc43Q3V0L5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Lrrc43Q3V0L5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lrrc43Q3V0L5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lrrc43Q3V0L5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lrrc43Q3V0L5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lrrc43Q3V0L5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrrc43Q3V0L5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrrc43Q3V0L5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrrc43Q3V0L5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Lrrc43Q3V0L5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Lrrc43Q3V0L5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrrc43Q3V0L5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrrc43Q3V0L5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrrc43Q3V0L5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrrc43Q3V0L5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrrc43Q3V0L5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Lrrc43Q3V0L5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Lrrc43Q3V0L5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lrrc43Q3V0L5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrrc43Q3V0L5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrrc43Q3V0L5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrrc43Q3V0L5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrrc43Q3V0L5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrrc43Q3V0L5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lrrc43Q3V0L5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrrc43Q3V0L5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrrc43Q3V0L5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrrc43Q3V0L5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lrrc43Q3V0L5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrrc43Q3V0L5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrrc43Q3V0L5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lrrc43Q3V0L5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lrrc43Q3V0L5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Lrrc43Q3V0L5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Lrrc43Q3V0L5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Lrrc43Q3V0L5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lrrc43Q3V0L5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lrrc43Q3V0L5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lrrc43Q3V0L5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lrrc43Q3V0L5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lrrc43Q3V0L5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lrrc43Q3V0L5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lrrc43Q3V0L5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lrrc43Q3V0L5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Lrrc43Q3V0L5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lrrc43Q3V0L5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lrrc43Q3V0L5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lrrc43Q3V0L5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lrrc43Q3V0L5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lrrc43Q3V0L5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lrrc43Q3V0L5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Lrrc43Q3V0L5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lrrc43Q3V0L5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrrc43Q3V0L5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrrc43Q3V0L5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrrc43Q3V0L5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Lrrc43Q3V0L5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lrrc43Q3V0L5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lrrc43Q3V0L5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lrrc43Q3V0L5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lrrc43Q3V0L5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lrrc43Q3V0L5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.8 ms