Protein–RNA interactions for Protein: Q3V050

Slc47a2, Multidrug and toxin extrusion protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a2Q3V050 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc47a2Q3V050 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc47a2Q3V050 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc47a2Q3V050 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc47a2Q3V050 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc47a2Q3V050 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc47a2Q3V050 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc47a2Q3V050 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc47a2Q3V050 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc47a2Q3V050 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc47a2Q3V050 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc47a2Q3V050 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc47a2Q3V050 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc47a2Q3V050 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc47a2Q3V050 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc47a2Q3V050 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc47a2Q3V050 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc47a2Q3V050 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc47a2Q3V050 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc47a2Q3V050 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc47a2Q3V050 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc47a2Q3V050 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc47a2Q3V050 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc47a2Q3V050 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc47a2Q3V050 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc47a2Q3V050 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc47a2Q3V050 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc47a2Q3V050 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc47a2Q3V050 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc47a2Q3V050 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc47a2Q3V050 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc47a2Q3V050 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc47a2Q3V050 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc47a2Q3V050 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc47a2Q3V050 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc47a2Q3V050 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc47a2Q3V050 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc47a2Q3V050 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc47a2Q3V050 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc47a2Q3V050 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc47a2Q3V050 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc47a2Q3V050 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc47a2Q3V050 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc47a2Q3V050 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc47a2Q3V050 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc47a2Q3V050 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc47a2Q3V050 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc47a2Q3V050 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc47a2Q3V050 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc47a2Q3V050 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc47a2Q3V050 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc47a2Q3V050 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc47a2Q3V050 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc47a2Q3V050 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc47a2Q3V050 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms