Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm6Q3UZD5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm6Q3UZD5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm6Q3UZD5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm6Q3UZD5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm6Q3UZD5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm6Q3UZD5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prdm6Q3UZD5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Prdm6Q3UZD5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm6Q3UZD5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prdm6Q3UZD5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prdm6Q3UZD5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prdm6Q3UZD5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prdm6Q3UZD5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prdm6Q3UZD5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prdm6Q3UZD5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prdm6Q3UZD5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prdm6Q3UZD5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prdm6Q3UZD5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prdm6Q3UZD5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Prdm6Q3UZD5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prdm6Q3UZD5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prdm6Q3UZD5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prdm6Q3UZD5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prdm6Q3UZD5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm6Q3UZD5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm6Q3UZD5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prdm6Q3UZD5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm6Q3UZD5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm6Q3UZD5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prdm6Q3UZD5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Prdm6Q3UZD5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm6Q3UZD5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm6Q3UZD5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prdm6Q3UZD5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm6Q3UZD5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm6Q3UZD5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm6Q3UZD5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Prdm6Q3UZD5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm6Q3UZD5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm6Q3UZD5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm6Q3UZD5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm6Q3UZD5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Prdm6Q3UZD5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm6Q3UZD5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm6Q3UZD5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm6Q3UZD5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm6Q3UZD5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Prdm6Q3UZD5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm6Q3UZD5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Prdm6Q3UZD5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Prdm6Q3UZD5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm6Q3UZD5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm6Q3UZD5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm6Q3UZD5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm6Q3UZD5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm6Q3UZD5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Prdm6Q3UZD5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Prdm6Q3UZD5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm6Q3UZD5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Prdm6Q3UZD5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm6Q3UZD5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm6Q3UZD5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm6Q3UZD5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm6Q3UZD5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Prdm6Q3UZD5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm6Q3UZD5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm6Q3UZD5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Prdm6Q3UZD5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm6Q3UZD5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm6Q3UZD5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Prdm6Q3UZD5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm6Q3UZD5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm6Q3UZD5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm6Q3UZD5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm6Q3UZD5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Prdm6Q3UZD5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Prdm6Q3UZD5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm6Q3UZD5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Prdm6Q3UZD5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms