Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Kdm5aQ3UXZ9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Kdm5aQ3UXZ9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Kdm5aQ3UXZ9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Kdm5aQ3UXZ9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Kdm5aQ3UXZ9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Kdm5aQ3UXZ9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdm5aQ3UXZ9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdm5aQ3UXZ9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdm5aQ3UXZ9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Kdm5aQ3UXZ9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
Kdm5aQ3UXZ9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Kdm5aQ3UXZ9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Kdm5aQ3UXZ9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Kdm5aQ3UXZ9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Kdm5aQ3UXZ9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Kdm5aQ3UXZ9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Kdm5aQ3UXZ9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm5aQ3UXZ9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Kdm5aQ3UXZ9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm5aQ3UXZ9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm5aQ3UXZ9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Kdm5aQ3UXZ9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Kdm5aQ3UXZ9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Kdm5aQ3UXZ9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Kdm5aQ3UXZ9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5aQ3UXZ9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Kdm5aQ3UXZ9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Kdm5aQ3UXZ9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Kdm5aQ3UXZ9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Kdm5aQ3UXZ9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Kdm5aQ3UXZ9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Kdm5aQ3UXZ9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5aQ3UXZ9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5aQ3UXZ9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5aQ3UXZ9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5aQ3UXZ9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Kdm5aQ3UXZ9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Kdm5aQ3UXZ9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Kdm5aQ3UXZ9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Kdm5aQ3UXZ9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Kdm5aQ3UXZ9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Kdm5aQ3UXZ9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Kdm5aQ3UXZ9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Kdm5aQ3UXZ9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5aQ3UXZ9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Kdm5aQ3UXZ9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Kdm5aQ3UXZ9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm5aQ3UXZ9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5aQ3UXZ9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Kdm5aQ3UXZ9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5aQ3UXZ9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Kdm5aQ3UXZ9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5aQ3UXZ9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5aQ3UXZ9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Kdm5aQ3UXZ9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Kdm5aQ3UXZ9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5aQ3UXZ9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Kdm5aQ3UXZ9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Kdm5aQ3UXZ9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Kdm5aQ3UXZ9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5aQ3UXZ9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Kdm5aQ3UXZ9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5aQ3UXZ9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5aQ3UXZ9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Kdm5aQ3UXZ9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Kdm5aQ3UXZ9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Kdm5aQ3UXZ9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Kdm5aQ3UXZ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Kdm5aQ3UXZ9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Kdm5aQ3UXZ9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Kdm5aQ3UXZ9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5aQ3UXZ9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5aQ3UXZ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Kdm5aQ3UXZ9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms