Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
D130052B06RikQ3UW13 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
D130052B06RikQ3UW13 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
D130052B06RikQ3UW13 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
D130052B06RikQ3UW13 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms