Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Slfn4Q3UV66 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slfn4Q3UV66 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Slfn4Q3UV66 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Slfn4Q3UV66 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Slfn4Q3UV66 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slfn4Q3UV66 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slfn4Q3UV66 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slfn4Q3UV66 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Slfn4Q3UV66 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slfn4Q3UV66 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slfn4Q3UV66 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slfn4Q3UV66 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Slfn4Q3UV66 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slfn4Q3UV66 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slfn4Q3UV66 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Slfn4Q3UV66 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn4Q3UV66 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn4Q3UV66 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn4Q3UV66 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Slfn4Q3UV66 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slfn4Q3UV66 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Slfn4Q3UV66 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slfn4Q3UV66 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slfn4Q3UV66 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slfn4Q3UV66 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slfn4Q3UV66 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slfn4Q3UV66 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Slfn4Q3UV66 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Slfn4Q3UV66 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn4Q3UV66 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn4Q3UV66 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn4Q3UV66 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Slfn4Q3UV66 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn4Q3UV66 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn4Q3UV66 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn4Q3UV66 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn4Q3UV66 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn4Q3UV66 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slfn4Q3UV66 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slfn4Q3UV66 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slfn4Q3UV66 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn4Q3UV66 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slfn4Q3UV66 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms