Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nkain3Q3URJ8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nkain3Q3URJ8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkain3Q3URJ8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nkain3Q3URJ8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkain3Q3URJ8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nkain3Q3URJ8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkain3Q3URJ8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nkain3Q3URJ8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkain3Q3URJ8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkain3Q3URJ8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkain3Q3URJ8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nkain3Q3URJ8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Nkain3Q3URJ8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nkain3Q3URJ8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Nkain3Q3URJ8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nkain3Q3URJ8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nkain3Q3URJ8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nkain3Q3URJ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Nkain3Q3URJ8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Nkain3Q3URJ8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nkain3Q3URJ8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nkain3Q3URJ8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nkain3Q3URJ8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nkain3Q3URJ8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nkain3Q3URJ8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Nkain3Q3URJ8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nkain3Q3URJ8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nkain3Q3URJ8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nkain3Q3URJ8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nkain3Q3URJ8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nkain3Q3URJ8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nkain3Q3URJ8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nkain3Q3URJ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkain3Q3URJ8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.4 ms