Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
E130208F15RikQ3UPV3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
E130208F15RikQ3UPV3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
E130208F15RikQ3UPV3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E130208F15RikQ3UPV3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E130208F15RikQ3UPV3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms