Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMW8

Cln5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5 homolog, mousemouse

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Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln5Q3UMW8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cln5Q3UMW8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cln5Q3UMW8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cln5Q3UMW8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cln5Q3UMW8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cln5Q3UMW8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cln5Q3UMW8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cln5Q3UMW8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cln5Q3UMW8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cln5Q3UMW8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cln5Q3UMW8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cln5Q3UMW8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cln5Q3UMW8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cln5Q3UMW8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cln5Q3UMW8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cln5Q3UMW8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cln5Q3UMW8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cln5Q3UMW8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cln5Q3UMW8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cln5Q3UMW8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cln5Q3UMW8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cln5Q3UMW8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cln5Q3UMW8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cln5Q3UMW8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cln5Q3UMW8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cln5Q3UMW8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cln5Q3UMW8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cln5Q3UMW8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cln5Q3UMW8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cln5Q3UMW8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cln5Q3UMW8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cln5Q3UMW8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cln5Q3UMW8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cln5Q3UMW8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cln5Q3UMW8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cln5Q3UMW8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cln5Q3UMW8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cln5Q3UMW8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cln5Q3UMW8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cln5Q3UMW8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cln5Q3UMW8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cln5Q3UMW8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cln5Q3UMW8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cln5Q3UMW8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cln5Q3UMW8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cln5Q3UMW8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cln5Q3UMW8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cln5Q3UMW8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cln5Q3UMW8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cln5Q3UMW8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cln5Q3UMW8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cln5Q3UMW8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cln5Q3UMW8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cln5Q3UMW8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cln5Q3UMW8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cln5Q3UMW8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cln5Q3UMW8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cln5Q3UMW8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cln5Q3UMW8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cln5Q3UMW8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cln5Q3UMW8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cln5Q3UMW8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cln5Q3UMW8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cln5Q3UMW8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cln5Q3UMW8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cln5Q3UMW8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cln5Q3UMW8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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