Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mccc2Q3ULD5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mccc2Q3ULD5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mccc2Q3ULD5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mccc2Q3ULD5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mccc2Q3ULD5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mccc2Q3ULD5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mccc2Q3ULD5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mccc2Q3ULD5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mccc2Q3ULD5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mccc2Q3ULD5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mccc2Q3ULD5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mccc2Q3ULD5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mccc2Q3ULD5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mccc2Q3ULD5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mccc2Q3ULD5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mccc2Q3ULD5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mccc2Q3ULD5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mccc2Q3ULD5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mccc2Q3ULD5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mccc2Q3ULD5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Mccc2Q3ULD5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Mccc2Q3ULD5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms