Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Parp8Q3UD82 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Parp8Q3UD82 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Parp8Q3UD82 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Parp8Q3UD82 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms