Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tmem109Q3UBX0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmem109Q3UBX0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmem109Q3UBX0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmem109Q3UBX0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmem109Q3UBX0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmem109Q3UBX0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmem109Q3UBX0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tmem109Q3UBX0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmem109Q3UBX0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tmem109Q3UBX0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tmem109Q3UBX0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tmem109Q3UBX0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmem109Q3UBX0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmem109Q3UBX0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmem109Q3UBX0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmem109Q3UBX0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmem109Q3UBX0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tmem109Q3UBX0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tmem109Q3UBX0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmem109Q3UBX0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmem109Q3UBX0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tmem109Q3UBX0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmem109Q3UBX0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmem109Q3UBX0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmem109Q3UBX0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmem109Q3UBX0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tmem109Q3UBX0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmem109Q3UBX0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tmem109Q3UBX0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tmem109Q3UBX0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmem109Q3UBX0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmem109Q3UBX0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmem109Q3UBX0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tmem109Q3UBX0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tmem109Q3UBX0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tmem109Q3UBX0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmem109Q3UBX0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmem109Q3UBX0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmem109Q3UBX0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmem109Q3UBX0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tmem109Q3UBX0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmem109Q3UBX0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmem109Q3UBX0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tmem109Q3UBX0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmem109Q3UBX0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmem109Q3UBX0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmem109Q3UBX0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmem109Q3UBX0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmem109Q3UBX0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmem109Q3UBX0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmem109Q3UBX0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmem109Q3UBX0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tmem109Q3UBX0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmem109Q3UBX0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmem109Q3UBX0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmem109Q3UBX0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmem109Q3UBX0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tmem109Q3UBX0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmem109Q3UBX0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmem109Q3UBX0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmem109Q3UBX0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tmem109Q3UBX0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tmem109Q3UBX0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmem109Q3UBX0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tmem109Q3UBX0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmem109Q3UBX0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tmem109Q3UBX0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms