Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1T3

Brms1l, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1lQ3U1T3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brms1lQ3U1T3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Brms1lQ3U1T3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Brms1lQ3U1T3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brms1lQ3U1T3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Brms1lQ3U1T3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Brms1lQ3U1T3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Brms1lQ3U1T3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brms1lQ3U1T3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Brms1lQ3U1T3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brms1lQ3U1T3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Brms1lQ3U1T3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Brms1lQ3U1T3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Brms1lQ3U1T3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Brms1lQ3U1T3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Brms1lQ3U1T3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brms1lQ3U1T3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Brms1lQ3U1T3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brms1lQ3U1T3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brms1lQ3U1T3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Brms1lQ3U1T3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brms1lQ3U1T3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Brms1lQ3U1T3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brms1lQ3U1T3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Brms1lQ3U1T3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Brms1lQ3U1T3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brms1lQ3U1T3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brms1lQ3U1T3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Brms1lQ3U1T3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brms1lQ3U1T3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Brms1lQ3U1T3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Brms1lQ3U1T3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Brms1lQ3U1T3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Brms1lQ3U1T3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Brms1lQ3U1T3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Brms1lQ3U1T3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brms1lQ3U1T3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brms1lQ3U1T3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brms1lQ3U1T3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Brms1lQ3U1T3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brms1lQ3U1T3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Brms1lQ3U1T3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brms1lQ3U1T3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Brms1lQ3U1T3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Brms1lQ3U1T3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brms1lQ3U1T3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brms1lQ3U1T3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brms1lQ3U1T3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Brms1lQ3U1T3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Brms1lQ3U1T3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Brms1lQ3U1T3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Brms1lQ3U1T3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Brms1lQ3U1T3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Brms1lQ3U1T3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms