Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Ccdc136Q3TVA9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Ccdc136Q3TVA9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC42■■■■■ 4.31
Ccdc136Q3TVA9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Ccdc136Q3TVA9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
Ccdc136Q3TVA9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Ccdc136Q3TVA9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Ccdc136Q3TVA9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
Ccdc136Q3TVA9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
Ccdc136Q3TVA9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Ccdc136Q3TVA9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Ccdc136Q3TVA9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
Ccdc136Q3TVA9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Ccdc136Q3TVA9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Ccdc136Q3TVA9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
Ccdc136Q3TVA9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC41.91■■■■■ 4.3
Ccdc136Q3TVA9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
Ccdc136Q3TVA9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Ccdc136Q3TVA9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Ccdc136Q3TVA9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Ccdc136Q3TVA9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
Ccdc136Q3TVA9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Ccdc136Q3TVA9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Ccdc136Q3TVA9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Ccdc136Q3TVA9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
Ccdc136Q3TVA9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Ccdc136Q3TVA9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
Ccdc136Q3TVA9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Ccdc136Q3TVA9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
Ccdc136Q3TVA9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Ccdc136Q3TVA9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Ccdc136Q3TVA9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Ccdc136Q3TVA9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Ccdc136Q3TVA9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
Ccdc136Q3TVA9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
Ccdc136Q3TVA9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.78■■■■■ 4.28
Ccdc136Q3TVA9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Ccdc136Q3TVA9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Ccdc136Q3TVA9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC41.75■■■■■ 4.27
Ccdc136Q3TVA9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
Ccdc136Q3TVA9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
Ccdc136Q3TVA9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Ccdc136Q3TVA9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Ccdc136Q3TVA9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
Ccdc136Q3TVA9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC41.7■■■■■ 4.27
Ccdc136Q3TVA9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
Ccdc136Q3TVA9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC41.69■■■■■ 4.26
Ccdc136Q3TVA9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
Ccdc136Q3TVA9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Ccdc136Q3TVA9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
Ccdc136Q3TVA9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
Ccdc136Q3TVA9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
Ccdc136Q3TVA9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Ccdc136Q3TVA9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Ccdc136Q3TVA9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC41.65■■■■■ 4.26
Ccdc136Q3TVA9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Ccdc136Q3TVA9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
Ccdc136Q3TVA9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
Ccdc136Q3TVA9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.26
Ccdc136Q3TVA9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.63■■■■■ 4.25
Ccdc136Q3TVA9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Ccdc136Q3TVA9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
Ccdc136Q3TVA9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Ccdc136Q3TVA9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
Ccdc136Q3TVA9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
Ccdc136Q3TVA9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Ccdc136Q3TVA9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Ccdc136Q3TVA9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Ccdc136Q3TVA9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
Ccdc136Q3TVA9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
Ccdc136Q3TVA9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Ccdc136Q3TVA9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
Ccdc136Q3TVA9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Ccdc136Q3TVA9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
Ccdc136Q3TVA9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
Ccdc136Q3TVA9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC41.45■■■■■ 4.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms