Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tamm41Q3TUH1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tamm41Q3TUH1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tamm41Q3TUH1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tamm41Q3TUH1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1378.2 ms