Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3TTL0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3TTL0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Q3TTL0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3TTL0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Q3TTL0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3TTL0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3TTL0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Q3TTL0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3TTL0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Q3TTL0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Q3TTL0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3TTL0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3TTL0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3TTL0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3TTL0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3TTL0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Q3TTL0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Q3TTL0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Q3TTL0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3TTL0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3TTL0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3TTL0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3TTL0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3TTL0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Q3TTL0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3TTL0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3TTL0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Q3TTL0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3TTL0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3TTL0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3TTL0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3TTL0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Q3TTL0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Q3TTL0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3TTL0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Q3TTL0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Q3TTL0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3TTL0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3TTL0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3TTL0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Q3TTL0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Q3TTL0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3TTL0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Q3TTL0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3TTL0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3TTL0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3TTL0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3TTL0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3TTL0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Q3TTL0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3TTL0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3TTL0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Q3TTL0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3TTL0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3TTL0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Q3TTL0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3TTL0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3TTL0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q3TTL0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3TTL0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3TTL0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3TTL0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3TTL0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q3TTL0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3TTL0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3TTL0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q3TTL0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3TTL0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3TTL0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q3TTL0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3TTL0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q3TTL0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Q3TTL0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3TTL0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q3TTL0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3TTL0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q3TTL0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3TTL0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q3TTL0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3TTL0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3TTL0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3TTL0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3TTL0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3TTL0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3TTL0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q3TTL0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3TTL0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q3TTL0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3TTL0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3TTL0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q3TTL0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q3TTL0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q3TTL0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3TTL0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3TTL0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3TTL0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3TTL0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3TTL0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3TTL0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms