Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CiartQ3TQ03 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CiartQ3TQ03 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CiartQ3TQ03 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CiartQ3TQ03 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CiartQ3TQ03 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CiartQ3TQ03 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CiartQ3TQ03 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CiartQ3TQ03 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CiartQ3TQ03 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CiartQ3TQ03 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CiartQ3TQ03 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CiartQ3TQ03 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CiartQ3TQ03 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CiartQ3TQ03 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CiartQ3TQ03 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CiartQ3TQ03 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CiartQ3TQ03 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CiartQ3TQ03 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CiartQ3TQ03 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CiartQ3TQ03 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CiartQ3TQ03 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CiartQ3TQ03 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CiartQ3TQ03 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CiartQ3TQ03 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CiartQ3TQ03 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CiartQ3TQ03 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CiartQ3TQ03 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CiartQ3TQ03 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CiartQ3TQ03 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CiartQ3TQ03 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CiartQ3TQ03 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CiartQ3TQ03 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CiartQ3TQ03 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CiartQ3TQ03 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CiartQ3TQ03 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CiartQ3TQ03 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CiartQ3TQ03 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CiartQ3TQ03 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CiartQ3TQ03 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CiartQ3TQ03 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CiartQ3TQ03 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CiartQ3TQ03 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CiartQ3TQ03 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CiartQ3TQ03 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CiartQ3TQ03 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CiartQ3TQ03 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CiartQ3TQ03 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CiartQ3TQ03 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CiartQ3TQ03 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CiartQ3TQ03 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CiartQ3TQ03 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CiartQ3TQ03 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CiartQ3TQ03 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CiartQ3TQ03 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CiartQ3TQ03 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CiartQ3TQ03 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CiartQ3TQ03 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CiartQ3TQ03 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CiartQ3TQ03 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CiartQ3TQ03 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CiartQ3TQ03 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CiartQ3TQ03 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CiartQ3TQ03 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CiartQ3TQ03 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CiartQ3TQ03 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CiartQ3TQ03 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CiartQ3TQ03 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CiartQ3TQ03 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CiartQ3TQ03 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms