Protein–RNA interactions for Protein: Q3THK3

Gtf2f1, General transcription factor IIF subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f1Q3THK3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Gtf2f1Q3THK3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gtf2f1Q3THK3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gtf2f1Q3THK3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gtf2f1Q3THK3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Gtf2f1Q3THK3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Gtf2f1Q3THK3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Gtf2f1Q3THK3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Gtf2f1Q3THK3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2f1Q3THK3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2f1Q3THK3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2f1Q3THK3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2f1Q3THK3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Gtf2f1Q3THK3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf2f1Q3THK3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Gtf2f1Q3THK3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtf2f1Q3THK3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtf2f1Q3THK3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Gtf2f1Q3THK3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf2f1Q3THK3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Gtf2f1Q3THK3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Gtf2f1Q3THK3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gtf2f1Q3THK3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Gtf2f1Q3THK3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Gtf2f1Q3THK3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Gtf2f1Q3THK3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtf2f1Q3THK3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtf2f1Q3THK3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Gtf2f1Q3THK3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf2f1Q3THK3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf2f1Q3THK3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Gtf2f1Q3THK3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtf2f1Q3THK3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtf2f1Q3THK3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Gtf2f1Q3THK3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf2f1Q3THK3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Gtf2f1Q3THK3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf2f1Q3THK3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf2f1Q3THK3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Gtf2f1Q3THK3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtf2f1Q3THK3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Gtf2f1Q3THK3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtf2f1Q3THK3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtf2f1Q3THK3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Gtf2f1Q3THK3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Gtf2f1Q3THK3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtf2f1Q3THK3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Gtf2f1Q3THK3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2f1Q3THK3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2f1Q3THK3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2f1Q3THK3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2f1Q3THK3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Gtf2f1Q3THK3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtf2f1Q3THK3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Gtf2f1Q3THK3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gtf2f1Q3THK3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gtf2f1Q3THK3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Gtf2f1Q3THK3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Gtf2f1Q3THK3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf2f1Q3THK3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Gtf2f1Q3THK3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2f1Q3THK3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2f1Q3THK3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2f1Q3THK3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2f1Q3THK3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Gtf2f1Q3THK3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf2f1Q3THK3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf2f1Q3THK3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Gtf2f1Q3THK3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Gtf2f1Q3THK3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2f1Q3THK3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2f1Q3THK3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2f1Q3THK3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Gtf2f1Q3THK3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms