Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Samd12Q0VE29 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Samd12Q0VE29 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd12Q0VE29 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Samd12Q0VE29 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Samd12Q0VE29 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms