Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Znf541Q0GGX2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Znf541Q0GGX2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Znf541Q0GGX2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Znf541Q0GGX2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Znf541Q0GGX2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Znf541Q0GGX2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Znf541Q0GGX2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Znf541Q0GGX2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Znf541Q0GGX2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Znf541Q0GGX2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Znf541Q0GGX2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Znf541Q0GGX2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Znf541Q0GGX2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Znf541Q0GGX2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Znf541Q0GGX2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Znf541Q0GGX2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Znf541Q0GGX2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Znf541Q0GGX2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Znf541Q0GGX2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Znf541Q0GGX2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Znf541Q0GGX2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
Znf541Q0GGX2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Znf541Q0GGX2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Znf541Q0GGX2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Znf541Q0GGX2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Znf541Q0GGX2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Znf541Q0GGX2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Znf541Q0GGX2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Znf541Q0GGX2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Znf541Q0GGX2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Znf541Q0GGX2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Znf541Q0GGX2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Znf541Q0GGX2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Znf541Q0GGX2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Znf541Q0GGX2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Znf541Q0GGX2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Znf541Q0GGX2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Znf541Q0GGX2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Znf541Q0GGX2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Znf541Q0GGX2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Znf541Q0GGX2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Znf541Q0GGX2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Znf541Q0GGX2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Znf541Q0GGX2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Znf541Q0GGX2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Znf541Q0GGX2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Znf541Q0GGX2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Znf541Q0GGX2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Znf541Q0GGX2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Znf541Q0GGX2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Znf541Q0GGX2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Znf541Q0GGX2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Znf541Q0GGX2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Znf541Q0GGX2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Znf541Q0GGX2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Znf541Q0GGX2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Znf541Q0GGX2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Znf541Q0GGX2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Znf541Q0GGX2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Znf541Q0GGX2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Znf541Q0GGX2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Znf541Q0GGX2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Znf541Q0GGX2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Znf541Q0GGX2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Znf541Q0GGX2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Znf541Q0GGX2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Znf541Q0GGX2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Znf541Q0GGX2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Znf541Q0GGX2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Znf541Q0GGX2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Znf541Q0GGX2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Znf541Q0GGX2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Znf541Q0GGX2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Znf541Q0GGX2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Znf541Q0GGX2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Znf541Q0GGX2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Znf541Q0GGX2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Znf541Q0GGX2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Znf541Q0GGX2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Znf541Q0GGX2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Znf541Q0GGX2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Znf541Q0GGX2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Znf541Q0GGX2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Znf541Q0GGX2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Znf541Q0GGX2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Znf541Q0GGX2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Znf541Q0GGX2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Znf541Q0GGX2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Znf541Q0GGX2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Znf541Q0GGX2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Znf541Q0GGX2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Znf541Q0GGX2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Znf541Q0GGX2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Znf541Q0GGX2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Znf541Q0GGX2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Znf541Q0GGX2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Znf541Q0GGX2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Znf541Q0GGX2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Znf541Q0GGX2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms