Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd8Q09XV5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Chd8Q09XV5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Chd8Q09XV5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Chd8Q09XV5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd8Q09XV5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd8Q09XV5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Chd8Q09XV5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd8Q09XV5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Chd8Q09XV5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd8Q09XV5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd8Q09XV5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd8Q09XV5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd8Q09XV5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Chd8Q09XV5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd8Q09XV5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Chd8Q09XV5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Chd8Q09XV5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Chd8Q09XV5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Chd8Q09XV5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Chd8Q09XV5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd8Q09XV5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd8Q09XV5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd8Q09XV5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd8Q09XV5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd8Q09XV5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd8Q09XV5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd8Q09XV5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd8Q09XV5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd8Q09XV5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd8Q09XV5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms