Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Pate4Q09098 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pate4Q09098 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pate4Q09098 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pate4Q09098 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pate4Q09098 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pate4Q09098 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pate4Q09098 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pate4Q09098 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pate4Q09098 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pate4Q09098 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Pate4Q09098 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Pate4Q09098 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pate4Q09098 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pate4Q09098 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Pate4Q09098 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pate4Q09098 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Pate4Q09098 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pate4Q09098 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pate4Q09098 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pate4Q09098 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pate4Q09098 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pate4Q09098 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pate4Q09098 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pate4Q09098 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pate4Q09098 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pate4Q09098 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pate4Q09098 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pate4Q09098 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Pate4Q09098 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pate4Q09098 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pate4Q09098 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pate4Q09098 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pate4Q09098 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pate4Q09098 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pate4Q09098 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.6 ms