Protein–RNA interactions for Protein: Q08EG8

Krtap10-4, Keratin-associated protein 10-4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap10-4Q08EG8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Krtap10-4Q08EG8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Krtap10-4Q08EG8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Krtap10-4Q08EG8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Krtap10-4Q08EG8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.3 ms